Ezkio-Itsaso se ubica al sur de Gipuzkoa, en el epicentro del Goierri. Administrativamente el municipio pertenece al Alto Urola, limitando con los municipios de Beasain, Ormaiztegi, Gabiria, Azpeitia y Zumárraga.
Este municipio tiene dos núcleos de población, Ezkio e Itsaso.
El municipio se encuentra recorrido por el río Santa Lucia a lo largo de 3 kilómetros.
Ezkio-Itsaso tiene una superficie de 21 kilómetros cuadrados y una altitud media de 300 metros sobre el nivel del mar. Puede accederse al municipio directamente a través de la GI-6322.
El punto más alto del municipio es el monte Izazpi, con una altitud de 965 metros.
En cuanto a la climatología, indicar que nos encontramos ante un clima oceánico, caracterizado por veranos frescos e inviernos moderados.

Distancias kilométricas por carretera
Donostia-San Sebastián 54 km
Bilbo-Bilbao 78 km
Vitoria-Gasteiz 62 km
Pamplona-Iruña 78 km
Baiona 96 km
Madrid 407km

Aeropuertos más próximos
Hondarribia (Donostia-San Sebastián)
Sondika (Bilbo-Bilbao)
Loiu (Bilbo-Bilbao)
Foronda (Vitoria-Gasteiz)
Noain (Iruña-Pamplona)